Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtatp6P00848 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtatp6P00848 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtatp6P00848 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtatp6P00848 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtatp6P00848 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtatp6P00848 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtatp6P00848 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtatp6P00848 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtatp6P00848 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtatp6P00848 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mtatp6P00848 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mtatp6P00848 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mtatp6P00848 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mtatp6P00848 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mtatp6P00848 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mtatp6P00848 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mtatp6P00848 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mtatp6P00848 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mtatp6P00848 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mtatp6P00848 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mtatp6P00848 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mtatp6P00848 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mtatp6P00848 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mtatp6P00848 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mtatp6P00848 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms