Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CopeO89079 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CopeO89079 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CopeO89079 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CopeO89079 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CopeO89079 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CopeO89079 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CopeO89079 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CopeO89079 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CopeO89079 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CopeO89079 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CopeO89079 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CopeO89079 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CopeO89079 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CopeO89079 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CopeO89079 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CopeO89079 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CopeO89079 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CopeO89079 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CopeO89079 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CopeO89079 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CopeO89079 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CopeO89079 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CopeO89079 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CopeO89079 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CopeO89079 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CopeO89079 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CopeO89079 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CopeO89079 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CopeO89079 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CopeO89079 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CopeO89079 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CopeO89079 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CopeO89079 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CopeO89079 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CopeO89079 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CopeO89079 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CopeO89079 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CopeO89079 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CopeO89079 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CopeO89079 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CopeO89079 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CopeO89079 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CopeO89079 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CopeO89079 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CopeO89079 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CopeO89079 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CopeO89079 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CopeO89079 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CopeO89079 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CopeO89079 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CopeO89079 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CopeO89079 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CopeO89079 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CopeO89079 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CopeO89079 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CopeO89079 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CopeO89079 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CopeO89079 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CopeO89079 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CopeO89079 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CopeO89079 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CopeO89079 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CopeO89079 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CopeO89079 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CopeO89079 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CopeO89079 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CopeO89079 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CopeO89079 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CopeO89079 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CopeO89079 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CopeO89079 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CopeO89079 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CopeO89079 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CopeO89079 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CopeO89079 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CopeO89079 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CopeO89079 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CopeO89079 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CopeO89079 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CopeO89079 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CopeO89079 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CopeO89079 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CopeO89079 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CopeO89079 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CopeO89079 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CopeO89079 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CopeO89079 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CopeO89079 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CopeO89079 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CopeO89079 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CopeO89079 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CopeO89079 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CopeO89079 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CopeO89079 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CopeO89079 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CopeO89079 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CopeO89079 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CopeO89079 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CopeO89079 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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