Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Actn3O88990 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Actn3O88990 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Actn3O88990 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Actn3O88990 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Actn3O88990 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Actn3O88990 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Actn3O88990 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Actn3O88990 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Actn3O88990 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Actn3O88990 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Actn3O88990 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Actn3O88990 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Actn3O88990 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Actn3O88990 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Actn3O88990 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Actn3O88990 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Actn3O88990 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Actn3O88990 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Actn3O88990 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Actn3O88990 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Actn3O88990 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Actn3O88990 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Actn3O88990 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Actn3O88990 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Actn3O88990 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Actn3O88990 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Actn3O88990 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Actn3O88990 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Actn3O88990 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Actn3O88990 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Actn3O88990 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Actn3O88990 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Actn3O88990 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Actn3O88990 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Actn3O88990 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Actn3O88990 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Actn3O88990 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Actn3O88990 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Actn3O88990 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Actn3O88990 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Actn3O88990 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Actn3O88990 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Actn3O88990 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Actn3O88990 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Actn3O88990 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Actn3O88990 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Actn3O88990 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Actn3O88990 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Actn3O88990 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Actn3O88990 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Actn3O88990 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Actn3O88990 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Actn3O88990 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Actn3O88990 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Actn3O88990 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Actn3O88990 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Actn3O88990 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Actn3O88990 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Actn3O88990 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Actn3O88990 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Actn3O88990 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Actn3O88990 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Actn3O88990 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Actn3O88990 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Actn3O88990 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Actn3O88990 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Actn3O88990 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Actn3O88990 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Actn3O88990 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Actn3O88990 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Actn3O88990 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Actn3O88990 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Actn3O88990 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Actn3O88990 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms