Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt3bO88509 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt3bO88509 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt3bO88509 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt3bO88509 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt3bO88509 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dnmt3bO88509 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt3bO88509 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt3bO88509 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnmt3bO88509 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnmt3bO88509 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnmt3bO88509 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnmt3bO88509 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnmt3bO88509 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnmt3bO88509 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnmt3bO88509 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnmt3bO88509 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnmt3bO88509 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnmt3bO88509 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnmt3bO88509 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnmt3bO88509 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnmt3bO88509 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnmt3bO88509 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnmt3bO88509 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnmt3bO88509 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnmt3bO88509 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnmt3bO88509 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnmt3bO88509 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnmt3bO88509 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnmt3bO88509 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnmt3bO88509 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnmt3bO88509 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnmt3bO88509 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dnmt3bO88509 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt3bO88509 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms