Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capns1O88456 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capns1O88456 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capns1O88456 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Capns1O88456 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capns1O88456 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capns1O88456 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capns1O88456 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Capns1O88456 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capns1O88456 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Capns1O88456 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capns1O88456 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capns1O88456 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capns1O88456 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capns1O88456 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capns1O88456 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capns1O88456 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capns1O88456 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capns1O88456 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capns1O88456 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capns1O88456 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capns1O88456 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capns1O88456 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capns1O88456 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capns1O88456 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capns1O88456 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capns1O88456 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns1O88456 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns1O88456 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns1O88456 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capns1O88456 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns1O88456 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns1O88456 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capns1O88456 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capns1O88456 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capns1O88456 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capns1O88456 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Capns1O88456 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capns1O88456 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capns1O88456 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Capns1O88456 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capns1O88456 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capns1O88456 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capns1O88456 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns1O88456 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns1O88456 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns1O88456 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns1O88456 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns1O88456 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capns1O88456 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capns1O88456 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capns1O88456 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capns1O88456 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capns1O88456 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capns1O88456 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capns1O88456 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capns1O88456 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capns1O88456 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capns1O88456 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms