Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms