Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srpk1O70551 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Srpk1O70551 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srpk1O70551 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srpk1O70551 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srpk1O70551 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srpk1O70551 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srpk1O70551 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Srpk1O70551 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Srpk1O70551 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Srpk1O70551 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Srpk1O70551 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srpk1O70551 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srpk1O70551 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srpk1O70551 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srpk1O70551 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srpk1O70551 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srpk1O70551 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srpk1O70551 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srpk1O70551 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srpk1O70551 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srpk1O70551 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srpk1O70551 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Srpk1O70551 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srpk1O70551 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srpk1O70551 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srpk1O70551 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srpk1O70551 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srpk1O70551 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srpk1O70551 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Srpk1O70551 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srpk1O70551 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srpk1O70551 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srpk1O70551 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srpk1O70551 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srpk1O70551 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srpk1O70551 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srpk1O70551 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srpk1O70551 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srpk1O70551 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Srpk1O70551 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srpk1O70551 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srpk1O70551 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srpk1O70551 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srpk1O70551 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srpk1O70551 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srpk1O70551 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srpk1O70551 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srpk1O70551 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srpk1O70551 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srpk1O70551 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srpk1O70551 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srpk1O70551 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Srpk1O70551 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Srpk1O70551 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srpk1O70551 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srpk1O70551 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srpk1O70551 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srpk1O70551 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srpk1O70551 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srpk1O70551 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srpk1O70551 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srpk1O70551 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srpk1O70551 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srpk1O70551 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srpk1O70551 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srpk1O70551 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srpk1O70551 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srpk1O70551 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srpk1O70551 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk1O70551 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk1O70551 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk1O70551 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk1O70551 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk1O70551 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk1O70551 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk1O70551 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms