Protein–RNA interactions for Protein: O55134

Pcdh12, Protocadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh12O55134 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdh12O55134 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh12O55134 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh12O55134 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh12O55134 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdh12O55134 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh12O55134 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh12O55134 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdh12O55134 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh12O55134 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh12O55134 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh12O55134 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh12O55134 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh12O55134 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdh12O55134 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh12O55134 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdh12O55134 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdh12O55134 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh12O55134 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh12O55134 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms