Protein–RNA interactions for Protein: O35969

Gamt, Guanidinoacetate N-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GamtO35969 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
GamtO35969 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
GamtO35969 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
GamtO35969 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
GamtO35969 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
GamtO35969 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
GamtO35969 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
GamtO35969 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
GamtO35969 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
GamtO35969 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
GamtO35969 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,42■■□□□ 1,02
GamtO35969 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
GamtO35969 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
GamtO35969 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
GamtO35969 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
GamtO35969 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
GamtO35969 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
GamtO35969 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,39■■□□□ 1,02
GamtO35969 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
GamtO35969 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,39■■□□□ 1,01
GamtO35969 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
GamtO35969 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
GamtO35969 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
GamtO35969 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
GamtO35969 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,37■■□□□ 1,01
GamtO35969 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21,37■■□□□ 1,01
GamtO35969 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
GamtO35969 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,36■■□□□ 1,01
GamtO35969 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,36■■□□□ 1,01
GamtO35969 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
GamtO35969 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21,33■■□□□ 1,01
GamtO35969 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,33■■□□□ 1,01
GamtO35969 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,33■■□□□ 1,01
GamtO35969 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
GamtO35969 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
GamtO35969 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
GamtO35969 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
GamtO35969 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
GamtO35969 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
GamtO35969 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
GamtO35969 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
GamtO35969 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
GamtO35969 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21,28■■□□□ 1
GamtO35969 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21,28■■□□□ 1
GamtO35969 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,28■■□□□ 1
GamtO35969 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
GamtO35969 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
GamtO35969 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
GamtO35969 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
GamtO35969 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
GamtO35969 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
GamtO35969 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
GamtO35969 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
GamtO35969 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
GamtO35969 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
GamtO35969 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
GamtO35969 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,24■□□□□ 0,99
GamtO35969 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
GamtO35969 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
GamtO35969 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
GamtO35969 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
GamtO35969 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
GamtO35969 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21,22■□□□□ 0,99
GamtO35969 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
GamtO35969 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
GamtO35969 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21,22■□□□□ 0,99
GamtO35969 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
GamtO35969 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
GamtO35969 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,99
GamtO35969 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
GamtO35969 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
GamtO35969 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
GamtO35969 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
GamtO35969 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
GamtO35969 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
GamtO35969 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
GamtO35969 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
GamtO35969 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21,15■□□□□ 0,98
GamtO35969 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
GamtO35969 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,15■□□□□ 0,98
GamtO35969 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
GamtO35969 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
GamtO35969 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
GamtO35969 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
GamtO35969 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
GamtO35969 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
GamtO35969 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
GamtO35969 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
GamtO35969 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
GamtO35969 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21,12■□□□□ 0,97
GamtO35969 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
GamtO35969 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
GamtO35969 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
GamtO35969 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
GamtO35969 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
GamtO35969 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
GamtO35969 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
GamtO35969 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
GamtO35969 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
GamtO35969 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,9 ms