Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctnnd2O35927 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd2O35927 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnd2O35927 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnd2O35927 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnd2O35927 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnd2O35927 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnd2O35927 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnd2O35927 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctnnd2O35927 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnd2O35927 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnd2O35927 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnd2O35927 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnd2O35927 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnd2O35927 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnd2O35927 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnd2O35927 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnd2O35927 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnd2O35927 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnd2O35927 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnd2O35927 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms