Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp100O35892 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp100O35892 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp100O35892 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp100O35892 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp100O35892 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp100O35892 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sp100O35892 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp100O35892 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp100O35892 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp100O35892 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp100O35892 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp100O35892 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp100O35892 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp100O35892 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp100O35892 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp100O35892 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp100O35892 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sp100O35892 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp100O35892 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp100O35892 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp100O35892 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp100O35892 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp100O35892 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp100O35892 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp100O35892 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp100O35892 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp100O35892 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp100O35892 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp100O35892 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp100O35892 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp100O35892 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp100O35892 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp100O35892 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp100O35892 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp100O35892 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp100O35892 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp100O35892 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Sp100O35892 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sp100O35892 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp100O35892 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp100O35892 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp100O35892 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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