Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chil3O35744 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chil3O35744 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chil3O35744 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chil3O35744 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chil3O35744 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chil3O35744 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chil3O35744 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chil3O35744 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chil3O35744 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chil3O35744 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Chil3O35744 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Chil3O35744 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Chil3O35744 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chil3O35744 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chil3O35744 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chil3O35744 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chil3O35744 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chil3O35744 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chil3O35744 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chil3O35744 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chil3O35744 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chil3O35744 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chil3O35744 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chil3O35744 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chil3O35744 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chil3O35744 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chil3O35744 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chil3O35744 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chil3O35744 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chil3O35744 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chil3O35744 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chil3O35744 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chil3O35744 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chil3O35744 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chil3O35744 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms