Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lhx8O35652 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lhx8O35652 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lhx8O35652 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lhx8O35652 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lhx8O35652 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lhx8O35652 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lhx8O35652 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lhx8O35652 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lhx8O35652 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lhx8O35652 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lhx8O35652 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lhx8O35652 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lhx8O35652 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lhx8O35652 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lhx8O35652 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lhx8O35652 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lhx8O35652 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhx8O35652 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhx8O35652 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhx8O35652 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhx8O35652 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lhx8O35652 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lhx8O35652 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lhx8O35652 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lhx8O35652 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lhx8O35652 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lhx8O35652 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lhx8O35652 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx8O35652 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx8O35652 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lhx8O35652 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lhx8O35652 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lhx8O35652 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lhx8O35652 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lhx8O35652 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lhx8O35652 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lhx8O35652 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lhx8O35652 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lhx8O35652 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lhx8O35652 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lhx8O35652 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lhx8O35652 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhx8O35652 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lhx8O35652 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms