Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stx1aO35526 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stx1aO35526 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Stx1aO35526 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stx1aO35526 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stx1aO35526 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stx1aO35526 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stx1aO35526 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stx1aO35526 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stx1aO35526 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stx1aO35526 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stx1aO35526 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stx1aO35526 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stx1aO35526 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stx1aO35526 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stx1aO35526 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stx1aO35526 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stx1aO35526 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stx1aO35526 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stx1aO35526 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stx1aO35526 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Stx1aO35526 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stx1aO35526 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stx1aO35526 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stx1aO35526 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx1aO35526 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx1aO35526 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx1aO35526 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx1aO35526 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stx1aO35526 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stx1aO35526 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stx1aO35526 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stx1aO35526 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stx1aO35526 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stx1aO35526 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stx1aO35526 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stx1aO35526 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stx1aO35526 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Stx1aO35526 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Stx1aO35526 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stx1aO35526 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stx1aO35526 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stx1aO35526 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stx1aO35526 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stx1aO35526 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stx1aO35526 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stx1aO35526 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stx1aO35526 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Stx1aO35526 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Stx1aO35526 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stx1aO35526 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stx1aO35526 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stx1aO35526 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stx1aO35526 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stx1aO35526 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stx1aO35526 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stx1aO35526 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stx1aO35526 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stx1aO35526 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms