Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NumblO08919 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NumblO08919 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NumblO08919 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NumblO08919 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NumblO08919 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NumblO08919 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NumblO08919 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NumblO08919 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NumblO08919 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NumblO08919 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NumblO08919 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NumblO08919 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NumblO08919 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NumblO08919 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NumblO08919 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NumblO08919 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NumblO08919 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NumblO08919 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NumblO08919 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NumblO08919 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NumblO08919 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NumblO08919 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NumblO08919 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NumblO08919 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NumblO08919 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NumblO08919 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NumblO08919 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NumblO08919 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NumblO08919 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NumblO08919 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NumblO08919 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NumblO08919 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NumblO08919 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NumblO08919 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NumblO08919 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NumblO08919 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NumblO08919 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NumblO08919 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NumblO08919 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NumblO08919 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NumblO08919 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NumblO08919 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NumblO08919 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NumblO08919 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NumblO08919 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NumblO08919 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NumblO08919 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NumblO08919 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NumblO08919 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NumblO08919 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NumblO08919 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NumblO08919 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NumblO08919 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NumblO08919 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NumblO08919 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NumblO08919 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NumblO08919 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NumblO08919 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NumblO08919 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NumblO08919 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NumblO08919 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NumblO08919 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NumblO08919 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NumblO08919 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NumblO08919 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NumblO08919 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NumblO08919 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NumblO08919 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NumblO08919 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NumblO08919 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NumblO08919 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NumblO08919 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NumblO08919 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NumblO08919 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NumblO08919 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NumblO08919 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NumblO08919 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NumblO08919 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NumblO08919 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NumblO08919 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NumblO08919 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NumblO08919 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NumblO08919 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NumblO08919 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NumblO08919 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NumblO08919 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NumblO08919 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NumblO08919 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NumblO08919 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NumblO08919 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NumblO08919 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NumblO08919 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NumblO08919 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NumblO08919 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NumblO08919 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NumblO08919 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NumblO08919 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NumblO08919 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NumblO08919 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms