Protein–RNA interactions for Protein: O08792

Ebf2, Transcription factor COE2, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf2O08792 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ebf2O08792 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ebf2O08792 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ebf2O08792 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ebf2O08792 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ebf2O08792 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ebf2O08792 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ebf2O08792 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ebf2O08792 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ebf2O08792 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ebf2O08792 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ebf2O08792 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ebf2O08792 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ebf2O08792 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ebf2O08792 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ebf2O08792 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ebf2O08792 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ebf2O08792 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ebf2O08792 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ebf2O08792 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ebf2O08792 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ebf2O08792 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ebf2O08792 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ebf2O08792 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ebf2O08792 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ebf2O08792 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ebf2O08792 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ebf2O08792 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ebf2O08792 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ebf2O08792 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ebf2O08792 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ebf2O08792 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ebf2O08792 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ebf2O08792 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms