Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Efna5O08543 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efna5O08543 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efna5O08543 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efna5O08543 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efna5O08543 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Efna5O08543 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Efna5O08543 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Efna5O08543 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Efna5O08543 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Efna5O08543 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Efna5O08543 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Efna5O08543 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Efna5O08543 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Efna5O08543 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Efna5O08543 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Efna5O08543 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Efna5O08543 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Efna5O08543 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Efna5O08543 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Efna5O08543 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Efna5O08543 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efna5O08543 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Efna5O08543 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Efna5O08543 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Efna5O08543 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Efna5O08543 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Efna5O08543 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Efna5O08543 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Efna5O08543 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efna5O08543 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Efna5O08543 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efna5O08543 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efna5O08543 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efna5O08543 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efna5O08543 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efna5O08543 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Efna5O08543 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Efna5O08543 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Efna5O08543 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Efna5O08543 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Efna5O08543 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Efna5O08543 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Efna5O08543 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Efna5O08543 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efna5O08543 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efna5O08543 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Efna5O08543 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Efna5O08543 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Efna5O08543 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efna5O08543 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efna5O08543 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efna5O08543 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efna5O08543 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efna5O08543 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efna5O08543 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Efna5O08543 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Efna5O08543 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Efna5O08543 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Efna5O08543 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Efna5O08543 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Efna5O08543 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Efna5O08543 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Efna5O08543 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Efna5O08543 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Efna5O08543 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Efna5O08543 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Efna5O08543 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Efna5O08543 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Efna5O08543 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Efna5O08543 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Efna5O08543 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms