Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna2d1O08532 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna2d1O08532 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna2d1O08532 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna2d1O08532 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna2d1O08532 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cacna2d1O08532 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna2d1O08532 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna2d1O08532 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna2d1O08532 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna2d1O08532 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna2d1O08532 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna2d1O08532 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna2d1O08532 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacna2d1O08532 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacna2d1O08532 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacna2d1O08532 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna2d1O08532 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d1O08532 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d1O08532 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d1O08532 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna2d1O08532 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna2d1O08532 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna2d1O08532 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna2d1O08532 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna2d1O08532 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna2d1O08532 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna2d1O08532 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna2d1O08532 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna2d1O08532 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna2d1O08532 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna2d1O08532 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna2d1O08532 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna2d1O08532 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna2d1O08532 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna2d1O08532 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna2d1O08532 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna2d1O08532 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cacna2d1O08532 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cacna2d1O08532 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna2d1O08532 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna2d1O08532 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna2d1O08532 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacna2d1O08532 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacna2d1O08532 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna2d1O08532 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna2d1O08532 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna2d1O08532 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna2d1O08532 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna2d1O08532 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna2d1O08532 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna2d1O08532 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna2d1O08532 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna2d1O08532 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna2d1O08532 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna2d1O08532 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna2d1O08532 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna2d1O08532 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna2d1O08532 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna2d1O08532 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna2d1O08532 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacna2d1O08532 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms