Protein–RNA interactions for Protein: L7N275

Vmn1r169, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r169L7N275 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r169L7N275 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r169L7N275 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r169L7N275 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r169L7N275 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r169L7N275 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vmn1r169L7N275 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vmn1r169L7N275 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vmn1r169L7N275 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r169L7N275 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r169L7N275 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r169L7N275 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r169L7N275 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vmn1r169L7N275 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r169L7N275 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r169L7N275 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r169L7N275 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn1r169L7N275 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r169L7N275 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn1r169L7N275 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r169L7N275 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r169L7N275 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r169L7N275 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r169L7N275 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r169L7N275 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r169L7N275 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r169L7N275 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r169L7N275 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r169L7N275 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn1r169L7N275 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn1r169L7N275 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r169L7N275 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r169L7N275 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r169L7N275 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vmn1r169L7N275 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Vmn1r169L7N275 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vmn1r169L7N275 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn1r169L7N275 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r169L7N275 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r169L7N275 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r169L7N275 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r169L7N275 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r169L7N275 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r169L7N275 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r169L7N275 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r169L7N275 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r169L7N275 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn1r169L7N275 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn1r169L7N275 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r169L7N275 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms