Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Vwa3bJ9JI28 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Vwa3bJ9JI28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Vwa3bJ9JI28 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Vwa3bJ9JI28 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Vwa3bJ9JI28 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Vwa3bJ9JI28 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Vwa3bJ9JI28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Vwa3bJ9JI28 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Vwa3bJ9JI28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Vwa3bJ9JI28 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Vwa3bJ9JI28 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,09■■■□□ 2,41
Vwa3bJ9JI28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Vwa3bJ9JI28 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Vwa3bJ9JI28 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Vwa3bJ9JI28 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Vwa3bJ9JI28 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Vwa3bJ9JI28 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Vwa3bJ9JI28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Vwa3bJ9JI28 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Vwa3bJ9JI28 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Vwa3bJ9JI28 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Vwa3bJ9JI28 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Vwa3bJ9JI28 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Vwa3bJ9JI28 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Vwa3bJ9JI28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Vwa3bJ9JI28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Vwa3bJ9JI28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Vwa3bJ9JI28 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Vwa3bJ9JI28 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Vwa3bJ9JI28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Vwa3bJ9JI28 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Vwa3bJ9JI28 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Vwa3bJ9JI28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Vwa3bJ9JI28 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Vwa3bJ9JI28 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Vwa3bJ9JI28 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Vwa3bJ9JI28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Vwa3bJ9JI28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Vwa3bJ9JI28 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Vwa3bJ9JI28 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Vwa3bJ9JI28 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms