Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20830J3KML6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20830J3KML6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20830J3KML6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20830J3KML6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20830J3KML6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20830J3KML6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20830J3KML6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20830J3KML6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20830J3KML6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20830J3KML6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20830J3KML6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms