Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Tubgcp6G5E8P0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Tubgcp6G5E8P0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Tubgcp6G5E8P0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Tubgcp6G5E8P0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Tubgcp6G5E8P0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Tubgcp6G5E8P0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Tubgcp6G5E8P0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Tubgcp6G5E8P0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Tubgcp6G5E8P0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Tubgcp6G5E8P0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Tubgcp6G5E8P0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Tubgcp6G5E8P0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Tubgcp6G5E8P0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Tubgcp6G5E8P0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Tubgcp6G5E8P0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Tubgcp6G5E8P0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Tubgcp6G5E8P0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Tubgcp6G5E8P0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Tubgcp6G5E8P0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Tubgcp6G5E8P0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Tubgcp6G5E8P0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Tubgcp6G5E8P0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Tubgcp6G5E8P0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Tubgcp6G5E8P0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Tubgcp6G5E8P0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Tubgcp6G5E8P0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Tubgcp6G5E8P0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Tubgcp6G5E8P0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Tubgcp6G5E8P0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Tubgcp6G5E8P0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Tubgcp6G5E8P0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Tubgcp6G5E8P0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Tubgcp6G5E8P0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Tubgcp6G5E8P0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Tubgcp6G5E8P0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Tubgcp6G5E8P0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Tubgcp6G5E8P0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Tubgcp6G5E8P0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Tubgcp6G5E8P0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Tubgcp6G5E8P0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Tubgcp6G5E8P0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Tubgcp6G5E8P0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Tubgcp6G5E8P0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Tubgcp6G5E8P0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Tubgcp6G5E8P0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Tubgcp6G5E8P0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Tubgcp6G5E8P0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Tubgcp6G5E8P0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Tubgcp6G5E8P0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Tubgcp6G5E8P0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Tubgcp6G5E8P0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Tubgcp6G5E8P0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Tubgcp6G5E8P0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Tubgcp6G5E8P0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Tubgcp6G5E8P0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Tubgcp6G5E8P0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Tubgcp6G5E8P0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Tubgcp6G5E8P0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Tubgcp6G5E8P0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Tubgcp6G5E8P0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Tubgcp6G5E8P0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Tubgcp6G5E8P0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Tubgcp6G5E8P0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Tubgcp6G5E8P0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Tubgcp6G5E8P0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Tubgcp6G5E8P0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Tubgcp6G5E8P0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Tubgcp6G5E8P0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Tubgcp6G5E8P0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Tubgcp6G5E8P0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Tubgcp6G5E8P0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Tubgcp6G5E8P0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Tubgcp6G5E8P0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Tubgcp6G5E8P0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Tubgcp6G5E8P0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Tubgcp6G5E8P0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Tubgcp6G5E8P0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Tubgcp6G5E8P0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Tubgcp6G5E8P0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Tubgcp6G5E8P0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Tubgcp6G5E8P0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Tubgcp6G5E8P0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Tubgcp6G5E8P0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Tubgcp6G5E8P0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Tubgcp6G5E8P0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Tubgcp6G5E8P0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Tubgcp6G5E8P0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Tubgcp6G5E8P0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Tubgcp6G5E8P0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Tubgcp6G5E8P0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Tubgcp6G5E8P0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms