Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp17lcG5E8I7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp17lcG5E8I7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp17lcG5E8I7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp17lcG5E8I7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp17lcG5E8I7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp17lcG5E8I7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Usp17lcG5E8I7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Usp17lcG5E8I7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Usp17lcG5E8I7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Usp17lcG5E8I7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp17lcG5E8I7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Usp17lcG5E8I7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp17lcG5E8I7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp17lcG5E8I7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp17lcG5E8I7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp17lcG5E8I7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp17lcG5E8I7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp17lcG5E8I7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp17lcG5E8I7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp17lcG5E8I7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp17lcG5E8I7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp17lcG5E8I7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp17lcG5E8I7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp17lcG5E8I7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp17lcG5E8I7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp17lcG5E8I7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp17lcG5E8I7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp17lcG5E8I7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp17lcG5E8I7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Usp17lcG5E8I7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp17lcG5E8I7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp17lcG5E8I7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp17lcG5E8I7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp17lcG5E8I7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp17lcG5E8I7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp17lcG5E8I7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp17lcG5E8I7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp17lcG5E8I7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp17lcG5E8I7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp17lcG5E8I7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp17lcG5E8I7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Usp17lcG5E8I7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Usp17lcG5E8I7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp17lcG5E8I7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp17lcG5E8I7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp17lcG5E8I7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp17lcG5E8I7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp17lcG5E8I7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp17lcG5E8I7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp17lcG5E8I7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp17lcG5E8I7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Usp17lcG5E8I7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp17lcG5E8I7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp17lcG5E8I7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Usp17lcG5E8I7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp17lcG5E8I7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp17lcG5E8I7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp17lcG5E8I7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp17lcG5E8I7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp17lcG5E8I7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp17lcG5E8I7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Usp17lcG5E8I7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp17lcG5E8I7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp17lcG5E8I7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp17lcG5E8I7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp17lcG5E8I7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp17lcG5E8I7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp17lcG5E8I7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp17lcG5E8I7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp17lcG5E8I7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp17lcG5E8I7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp17lcG5E8I7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp17lcG5E8I7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp17lcG5E8I7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp17lcG5E8I7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp17lcG5E8I7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp17lcG5E8I7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp17lcG5E8I7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp17lcG5E8I7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp17lcG5E8I7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp17lcG5E8I7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp17lcG5E8I7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp17lcG5E8I7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp17lcG5E8I7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp17lcG5E8I7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp17lcG5E8I7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp17lcG5E8I7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp17lcG5E8I7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp17lcG5E8I7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp17lcG5E8I7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp17lcG5E8I7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp17lcG5E8I7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp17lcG5E8I7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp17lcG5E8I7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp17lcG5E8I7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp17lcG5E8I7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp17lcG5E8I7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp17lcG5E8I7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
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