Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-M1F7CXU4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-M1F7CXU4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-M1F7CXU4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-M1F7CXU4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-M1F7CXU4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M1F7CXU4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M1F7CXU4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-M1F7CXU4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-M1F7CXU4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-M1F7CXU4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-M1F7CXU4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-M1F7CXU4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-M1F7CXU4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-M1F7CXU4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M1F7CXU4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M1F7CXU4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M1F7CXU4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M1F7CXU4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-M1F7CXU4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2-M1F7CXU4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-M1F7CXU4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M1F7CXU4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M1F7CXU4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M1F7CXU4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M1F7CXU4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M1F7CXU4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M1F7CXU4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M1F7CXU4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M1F7CXU4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M1F7CXU4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-M1F7CXU4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms