Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn2r35E9Q7U8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn2r35E9Q7U8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn2r35E9Q7U8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn2r35E9Q7U8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn2r35E9Q7U8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn2r35E9Q7U8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r35E9Q7U8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn2r35E9Q7U8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn2r35E9Q7U8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn2r35E9Q7U8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn2r35E9Q7U8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn2r35E9Q7U8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn2r35E9Q7U8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn2r35E9Q7U8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn2r35E9Q7U8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn2r35E9Q7U8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn2r35E9Q7U8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn2r35E9Q7U8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn2r35E9Q7U8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn2r35E9Q7U8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r35E9Q7U8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r35E9Q7U8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r35E9Q7U8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r35E9Q7U8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r35E9Q7U8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r35E9Q7U8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r35E9Q7U8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r35E9Q7U8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r35E9Q7U8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r35E9Q7U8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms