Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cdhr2E9Q7P9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cdhr2E9Q7P9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cdhr2E9Q7P9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cdhr2E9Q7P9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Cdhr2E9Q7P9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cdhr2E9Q7P9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cdhr2E9Q7P9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cdhr2E9Q7P9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cdhr2E9Q7P9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cdhr2E9Q7P9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cdhr2E9Q7P9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cdhr2E9Q7P9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cdhr2E9Q7P9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cdhr2E9Q7P9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cdhr2E9Q7P9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cdhr2E9Q7P9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cdhr2E9Q7P9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cdhr2E9Q7P9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cdhr2E9Q7P9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cdhr2E9Q7P9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cdhr2E9Q7P9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cdhr2E9Q7P9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cdhr2E9Q7P9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cdhr2E9Q7P9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cdhr2E9Q7P9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Cdhr2E9Q7P9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Cdhr2E9Q7P9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cdhr2E9Q7P9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cdhr2E9Q7P9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cdhr2E9Q7P9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cdhr2E9Q7P9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Cdhr2E9Q7P9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cdhr2E9Q7P9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cdhr2E9Q7P9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cdhr2E9Q7P9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cdhr2E9Q7P9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cdhr2E9Q7P9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cdhr2E9Q7P9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdhr2E9Q7P9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cdhr2E9Q7P9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cdhr2E9Q7P9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdhr2E9Q7P9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cdhr2E9Q7P9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cdhr2E9Q7P9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdhr2E9Q7P9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdhr2E9Q7P9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdhr2E9Q7P9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdhr2E9Q7P9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdhr2E9Q7P9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdhr2E9Q7P9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdhr2E9Q7P9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cdhr2E9Q7P9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cdhr2E9Q7P9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cdhr2E9Q7P9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cdhr2E9Q7P9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cdhr2E9Q7P9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdhr2E9Q7P9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdhr2E9Q7P9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cdhr2E9Q7P9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cdhr2E9Q7P9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cdhr2E9Q7P9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cdhr2E9Q7P9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cdhr2E9Q7P9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdhr2E9Q7P9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Cdhr2E9Q7P9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdhr2E9Q7P9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cdhr2E9Q7P9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdhr2E9Q7P9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdhr2E9Q7P9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdhr2E9Q7P9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdhr2E9Q7P9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdhr2E9Q7P9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdhr2E9Q7P9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cdhr2E9Q7P9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cdhr2E9Q7P9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cdhr2E9Q7P9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cdhr2E9Q7P9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cdhr2E9Q7P9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cdhr2E9Q7P9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cdhr2E9Q7P9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Cdhr2E9Q7P9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cdhr2E9Q7P9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cdhr2E9Q7P9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cdhr2E9Q7P9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cdhr2E9Q7P9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cdhr2E9Q7P9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cdhr2E9Q7P9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms