Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
1700024B05RikE9Q6D7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700024B05RikE9Q6D7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
1700024B05RikE9Q6D7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
1700024B05RikE9Q6D7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700024B05RikE9Q6D7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700024B05RikE9Q6D7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
1700024B05RikE9Q6D7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700024B05RikE9Q6D7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700024B05RikE9Q6D7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700024B05RikE9Q6D7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700024B05RikE9Q6D7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700024B05RikE9Q6D7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700024B05RikE9Q6D7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700024B05RikE9Q6D7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700024B05RikE9Q6D7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700024B05RikE9Q6D7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700024B05RikE9Q6D7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700024B05RikE9Q6D7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700024B05RikE9Q6D7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700024B05RikE9Q6D7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700024B05RikE9Q6D7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700024B05RikE9Q6D7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700024B05RikE9Q6D7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700024B05RikE9Q6D7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700024B05RikE9Q6D7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700024B05RikE9Q6D7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700024B05RikE9Q6D7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700024B05RikE9Q6D7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700024B05RikE9Q6D7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700024B05RikE9Q6D7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms