Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r48E9Q5D8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r48E9Q5D8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r48E9Q5D8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r48E9Q5D8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r48E9Q5D8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r48E9Q5D8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r48E9Q5D8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r48E9Q5D8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r48E9Q5D8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r48E9Q5D8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r48E9Q5D8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r48E9Q5D8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn2r48E9Q5D8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r48E9Q5D8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r48E9Q5D8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r48E9Q5D8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r48E9Q5D8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r48E9Q5D8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r48E9Q5D8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r48E9Q5D8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r48E9Q5D8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r48E9Q5D8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r48E9Q5D8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r48E9Q5D8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r48E9Q5D8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r48E9Q5D8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r48E9Q5D8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r48E9Q5D8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r48E9Q5D8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r48E9Q5D8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r48E9Q5D8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r48E9Q5D8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn2r48E9Q5D8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms