Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep350E9Q309 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cep350E9Q309 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cep350E9Q309 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep350E9Q309 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cep350E9Q309 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Cep350E9Q309 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep350E9Q309 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cep350E9Q309 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cep350E9Q309 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep350E9Q309 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep350E9Q309 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cep350E9Q309 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cep350E9Q309 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep350E9Q309 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep350E9Q309 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cep350E9Q309 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cep350E9Q309 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cep350E9Q309 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep350E9Q309 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep350E9Q309 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep350E9Q309 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep350E9Q309 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep350E9Q309 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep350E9Q309 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep350E9Q309 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep350E9Q309 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep350E9Q309 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep350E9Q309 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep350E9Q309 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep350E9Q309 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cep350E9Q309 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep350E9Q309 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep350E9Q309 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep350E9Q309 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep350E9Q309 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep350E9Q309 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cep350E9Q309 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep350E9Q309 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep350E9Q309 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep350E9Q309 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep350E9Q309 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep350E9Q309 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep350E9Q309 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep350E9Q309 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep350E9Q309 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep350E9Q309 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep350E9Q309 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep350E9Q309 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep350E9Q309 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep350E9Q309 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep350E9Q309 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cep350E9Q309 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms