Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3250E9Q1M3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3250E9Q1M3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3250E9Q1M3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms