Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfta2E9PXB6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfta2E9PXB6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfta2E9PXB6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfta2E9PXB6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfta2E9PXB6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfta2E9PXB6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms