Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG4

Crisp4, Cysteine-rich secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp4E9PVG4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crisp4E9PVG4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crisp4E9PVG4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crisp4E9PVG4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crisp4E9PVG4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crisp4E9PVG4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crisp4E9PVG4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crisp4E9PVG4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Crisp4E9PVG4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Crisp4E9PVG4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crisp4E9PVG4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Crisp4E9PVG4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crisp4E9PVG4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crisp4E9PVG4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crisp4E9PVG4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crisp4E9PVG4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crisp4E9PVG4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Crisp4E9PVG4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Crisp4E9PVG4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Crisp4E9PVG4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Crisp4E9PVG4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Crisp4E9PVG4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Crisp4E9PVG4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Crisp4E9PVG4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crisp4E9PVG4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crisp4E9PVG4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crisp4E9PVG4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crisp4E9PVG4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crisp4E9PVG4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crisp4E9PVG4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crisp4E9PVG4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crisp4E9PVG4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crisp4E9PVG4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crisp4E9PVG4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Crisp4E9PVG4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crisp4E9PVG4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crisp4E9PVG4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crisp4E9PVG4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crisp4E9PVG4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crisp4E9PVG4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crisp4E9PVG4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Crisp4E9PVG4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crisp4E9PVG4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crisp4E9PVG4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crisp4E9PVG4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crisp4E9PVG4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crisp4E9PVG4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Crisp4E9PVG4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crisp4E9PVG4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crisp4E9PVG4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crisp4E9PVG4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crisp4E9PVG4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crisp4E9PVG4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crisp4E9PVG4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crisp4E9PVG4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crisp4E9PVG4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crisp4E9PVG4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crisp4E9PVG4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms