Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrt2E9PUL5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt2E9PUL5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt2E9PUL5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrt2E9PUL5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt2E9PUL5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt2E9PUL5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt2E9PUL5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt2E9PUL5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt2E9PUL5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt2E9PUL5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrt2E9PUL5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrt2E9PUL5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrt2E9PUL5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrt2E9PUL5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrt2E9PUL5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrt2E9PUL5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrt2E9PUL5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrt2E9PUL5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrt2E9PUL5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrt2E9PUL5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrt2E9PUL5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrt2E9PUL5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrt2E9PUL5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt2E9PUL5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt2E9PUL5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt2E9PUL5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt2E9PUL5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt2E9PUL5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt2E9PUL5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt2E9PUL5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrt2E9PUL5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt2E9PUL5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt2E9PUL5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt2E9PUL5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt2E9PUL5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrt2E9PUL5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt2E9PUL5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt2E9PUL5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrt2E9PUL5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrt2E9PUL5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms