Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Soga1E1U8D0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,11■■■■■ 4,17
Soga1E1U8D0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC41,1■■■■■ 4,17
Soga1E1U8D0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Soga1E1U8D0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
Soga1E1U8D0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Soga1E1U8D0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Soga1E1U8D0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC41,08■■■■■ 4,17
Soga1E1U8D0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC41,08■■■■■ 4,17
Soga1E1U8D0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,16
Soga1E1U8D0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,16
Soga1E1U8D0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,16
Soga1E1U8D0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Soga1E1U8D0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,02■■■■■ 4,16
Soga1E1U8D0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,15
Soga1E1U8D0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4,15
Soga1E1U8D0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,98■■■■■ 4,15
Soga1E1U8D0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40,98■■■■■ 4,15
Soga1E1U8D0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,98■■■■■ 4,15
Soga1E1U8D0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,98■■■■■ 4,15
Soga1E1U8D0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40,97■■■■■ 4,15
Soga1E1U8D0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Soga1E1U8D0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,93■■■■■ 4,14
Soga1E1U8D0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,93■■■■■ 4,14
Soga1E1U8D0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,92■■■■■ 4,14
Soga1E1U8D0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,92■■■■■ 4,14
Soga1E1U8D0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Soga1E1U8D0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40,88■■■■■ 4,13
Soga1E1U8D0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Soga1E1U8D0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,82■■■■■ 4,13
Soga1E1U8D0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
Soga1E1U8D0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
Soga1E1U8D0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40,8■■■■■ 4,12
Soga1E1U8D0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Soga1E1U8D0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Soga1E1U8D0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Soga1E1U8D0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC40,7■■■■■ 4,11
Soga1E1U8D0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40,7■■■■■ 4,11
Soga1E1U8D0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC40,7■■■■■ 4,11
Soga1E1U8D0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Soga1E1U8D0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,69■■■■■ 4,11
Soga1E1U8D0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40,69■■■■■ 4,1
Soga1E1U8D0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
Soga1E1U8D0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Soga1E1U8D0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Soga1E1U8D0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40,63■■■■■ 4,09
Soga1E1U8D0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,63■■■■■ 4,09
Soga1E1U8D0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40,63■■■■■ 4,09
Soga1E1U8D0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
Soga1E1U8D0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Soga1E1U8D0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Soga1E1U8D0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Soga1E1U8D0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Soga1E1U8D0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40,59■■■■■ 4,09
Soga1E1U8D0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Soga1E1U8D0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Soga1E1U8D0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,56■■■■■ 4,08
Soga1E1U8D0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40,55■■■■■ 4,08
Soga1E1U8D0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Soga1E1U8D0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Soga1E1U8D0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Soga1E1U8D0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Soga1E1U8D0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40,51■■■■■ 4,08
Soga1E1U8D0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Soga1E1U8D0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40,49■■■■■ 4,07
Soga1E1U8D0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40,47■■■■■ 4,07
Soga1E1U8D0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40,45■■■■■ 4,07
Soga1E1U8D0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,07
Soga1E1U8D0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Soga1E1U8D0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Soga1E1U8D0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Soga1E1U8D0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Soga1E1U8D0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Soga1E1U8D0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40,41■■■■■ 4,06
Soga1E1U8D0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40,4■■■■■ 4,06
Soga1E1U8D0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Soga1E1U8D0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,38■■■■■ 4,05
Soga1E1U8D0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40,34■■■■■ 4,05
Soga1E1U8D0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Soga1E1U8D0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Soga1E1U8D0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40,33■■■■■ 4,05
Soga1E1U8D0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40,33■■■■■ 4,05
Soga1E1U8D0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Soga1E1U8D0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40,33■■■■■ 4,05
Soga1E1U8D0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Soga1E1U8D0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Soga1E1U8D0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,04
Soga1E1U8D0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,32■■■■■ 4,04
Soga1E1U8D0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40,31■■■■■ 4,04
Soga1E1U8D0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Soga1E1U8D0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Soga1E1U8D0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Soga1E1U8D0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Soga1E1U8D0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Soga1E1U8D0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Soga1E1U8D0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Soga1E1U8D0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40,23■■■■■ 4,03
Soga1E1U8D0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
Soga1E1U8D0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Soga1E1U8D0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms