Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl3E0CZ16 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl3E0CZ16 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl3E0CZ16 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl3E0CZ16 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl3E0CZ16 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl3E0CZ16 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl3E0CZ16 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl3E0CZ16 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl3E0CZ16 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl3E0CZ16 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl3E0CZ16 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl3E0CZ16 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl3E0CZ16 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl3E0CZ16 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl3E0CZ16 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl3E0CZ16 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl3E0CZ16 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl3E0CZ16 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl3E0CZ16 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl3E0CZ16 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl3E0CZ16 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms