Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vpreb3D3Z6J4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vpreb3D3Z6J4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vpreb3D3Z6J4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vpreb3D3Z6J4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb3D3Z6J4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms