Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tgfbr3lD3YZZ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tgfbr3lD3YZZ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Tgfbr3lD3YZZ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Tgfbr3lD3YZZ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tgfbr3lD3YZZ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tgfbr3lD3YZZ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tgfbr3lD3YZZ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tgfbr3lD3YZZ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tgfbr3lD3YZZ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Tgfbr3lD3YZZ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Tgfbr3lD3YZZ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tgfbr3lD3YZZ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Tgfbr3lD3YZZ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Tgfbr3lD3YZZ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Tgfbr3lD3YZZ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Tgfbr3lD3YZZ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Tgfbr3lD3YZZ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Tgfbr3lD3YZZ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Tgfbr3lD3YZZ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Tgfbr3lD3YZZ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Tgfbr3lD3YZZ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Tgfbr3lD3YZZ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25,92■■□□□ 1,74
Tgfbr3lD3YZZ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Tgfbr3lD3YZZ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Tgfbr3lD3YZZ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Tgfbr3lD3YZZ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Tgfbr3lD3YZZ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Tgfbr3lD3YZZ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tgfbr3lD3YZZ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tgfbr3lD3YZZ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tgfbr3lD3YZZ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tgfbr3lD3YZZ2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Tgfbr3lD3YZZ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Tgfbr3lD3YZZ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Tgfbr3lD3YZZ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Tgfbr3lD3YZZ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Tgfbr3lD3YZZ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Tgfbr3lD3YZZ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Tgfbr3lD3YZZ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Tgfbr3lD3YZZ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,7■■□□□ 1,71
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Tgfbr3lD3YZZ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Tgfbr3lD3YZZ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Tgfbr3lD3YZZ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Tgfbr3lD3YZZ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tgfbr3lD3YZZ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tgfbr3lD3YZZ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,2 ms