Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apol6B7ZC55 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apol6B7ZC55 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Apol6B7ZC55 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apol6B7ZC55 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Apol6B7ZC55 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apol6B7ZC55 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apol6B7ZC55 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apol6B7ZC55 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apol6B7ZC55 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apol6B7ZC55 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Apol6B7ZC55 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apol6B7ZC55 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apol6B7ZC55 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apol6B7ZC55 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apol6B7ZC55 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apol6B7ZC55 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apol6B7ZC55 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Apol6B7ZC55 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Apol6B7ZC55 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apol6B7ZC55 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apol6B7ZC55 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apol6B7ZC55 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apol6B7ZC55 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apol6B7ZC55 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apol6B7ZC55 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apol6B7ZC55 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apol6B7ZC55 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apol6B7ZC55 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apol6B7ZC55 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apol6B7ZC55 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apol6B7ZC55 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apol6B7ZC55 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apol6B7ZC55 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apol6B7ZC55 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apol6B7ZC55 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apol6B7ZC55 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apol6B7ZC55 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apol6B7ZC55 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Apol6B7ZC55 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apol6B7ZC55 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apol6B7ZC55 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apol6B7ZC55 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apol6B7ZC55 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apol6B7ZC55 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apol6B7ZC55 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apol6B7ZC55 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apol6B7ZC55 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Apol6B7ZC55 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apol6B7ZC55 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apol6B7ZC55 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apol6B7ZC55 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apol6B7ZC55 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apol6B7ZC55 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Apol6B7ZC55 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apol6B7ZC55 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms