Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Fam71aB7XG49 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam71aB7XG49 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam71aB7XG49 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam71aB7XG49 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam71aB7XG49 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam71aB7XG49 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam71aB7XG49 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam71aB7XG49 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam71aB7XG49 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam71aB7XG49 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam71aB7XG49 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam71aB7XG49 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam71aB7XG49 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam71aB7XG49 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam71aB7XG49 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam71aB7XG49 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fam71aB7XG49 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam71aB7XG49 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam71aB7XG49 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam71aB7XG49 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam71aB7XG49 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam71aB7XG49 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam71aB7XG49 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam71aB7XG49 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam71aB7XG49 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam71aB7XG49 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fam71aB7XG49 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71aB7XG49 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71aB7XG49 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71aB7XG49 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam71aB7XG49 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71aB7XG49 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fam71aB7XG49 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam71aB7XG49 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam71aB7XG49 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms