Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud4B2RRE7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud4B2RRE7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud4B2RRE7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Otud4B2RRE7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud4B2RRE7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud4B2RRE7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud4B2RRE7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud4B2RRE7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud4B2RRE7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud4B2RRE7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud4B2RRE7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud4B2RRE7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud4B2RRE7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otud4B2RRE7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud4B2RRE7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud4B2RRE7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud4B2RRE7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otud4B2RRE7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud4B2RRE7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud4B2RRE7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud4B2RRE7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud4B2RRE7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud4B2RRE7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Otud4B2RRE7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Otud4B2RRE7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otud4B2RRE7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otud4B2RRE7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otud4B2RRE7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud4B2RRE7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud4B2RRE7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud4B2RRE7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud4B2RRE7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud4B2RRE7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud4B2RRE7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otud4B2RRE7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud4B2RRE7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud4B2RRE7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms