Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC035947B2RQY6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC035947B2RQY6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC035947B2RQY6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC035947B2RQY6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC035947B2RQY6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC035947B2RQY6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BC035947B2RQY6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC035947B2RQY6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC035947B2RQY6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC035947B2RQY6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC035947B2RQY6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC035947B2RQY6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC035947B2RQY6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC035947B2RQY6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC035947B2RQY6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC035947B2RQY6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC035947B2RQY6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BC035947B2RQY6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC035947B2RQY6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC035947B2RQY6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC035947B2RQY6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC035947B2RQY6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC035947B2RQY6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BC035947B2RQY6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC035947B2RQY6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC035947B2RQY6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BC035947B2RQY6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC035947B2RQY6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC035947B2RQY6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC035947B2RQY6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC035947B2RQY6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC035947B2RQY6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC035947B2RQY6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC035947B2RQY6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC035947B2RQY6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC035947B2RQY6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC035947B2RQY6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC035947B2RQY6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC035947B2RQY6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC035947B2RQY6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC035947B2RQY6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC035947B2RQY6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC035947B2RQY6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC035947B2RQY6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC035947B2RQY6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC035947B2RQY6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC035947B2RQY6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms