Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem238A9JSM3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem238A9JSM3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem238A9JSM3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem238A9JSM3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem238A9JSM3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms