Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Odf2A3KGV1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Odf2A3KGV1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Odf2A3KGV1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Odf2A3KGV1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Odf2A3KGV1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Odf2A3KGV1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Odf2A3KGV1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Odf2A3KGV1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Odf2A3KGV1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Odf2A3KGV1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Odf2A3KGV1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Odf2A3KGV1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Odf2A3KGV1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Odf2A3KGV1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Odf2A3KGV1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.55■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Odf2A3KGV1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Odf2A3KGV1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Odf2A3KGV1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Odf2A3KGV1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Odf2A3KGV1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Odf2A3KGV1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Odf2A3KGV1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Odf2A3KGV1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Odf2A3KGV1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Odf2A3KGV1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Odf2A3KGV1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Odf2A3KGV1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Odf2A3KGV1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Odf2A3KGV1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Odf2A3KGV1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Odf2A3KGV1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Odf2A3KGV1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Odf2A3KGV1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Odf2A3KGV1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Odf2A3KGV1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Odf2A3KGV1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Odf2A3KGV1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Odf2A3KGV1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Odf2A3KGV1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Odf2A3KGV1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Odf2A3KGV1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Odf2A3KGV1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Odf2A3KGV1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Odf2A3KGV1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Odf2A3KGV1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Odf2A3KGV1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Odf2A3KGV1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Odf2A3KGV1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Odf2A3KGV1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Odf2A3KGV1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Odf2A3KGV1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Odf2A3KGV1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Odf2A3KGV1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Odf2A3KGV1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Odf2A3KGV1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Odf2A3KGV1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms