Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc9bA3KGF9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9bA3KGF9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9bA3KGF9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc9bA3KGF9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc9bA3KGF9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9bA3KGF9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9bA3KGF9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9bA3KGF9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9bA3KGF9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc9bA3KGF9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9bA3KGF9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9bA3KGF9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9bA3KGF9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9bA3KGF9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9bA3KGF9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9bA3KGF9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9bA3KGF9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc9bA3KGF9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9bA3KGF9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9bA3KGF9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9bA3KGF9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9bA3KGF9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc9bA3KGF9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc9bA3KGF9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc9bA3KGF9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc9bA3KGF9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc9bA3KGF9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc9bA3KGF9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc9bA3KGF9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc9bA3KGF9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9bA3KGF9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc9bA3KGF9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc9bA3KGF9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9bA3KGF9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9bA3KGF9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc9bA3KGF9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc9bA3KGF9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms