Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34,45■■■■□ 3,1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34,39■■■■□ 3,1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34,3■■■■□ 3,08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34,23■■■■□ 3,07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34,07■■■■□ 3,05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33,98■■■■□ 3,03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33,95■■■■□ 3,03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33,89■■■■□ 3,02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33,85■■■■□ 3,01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33,8■■■■□ 3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33,77■■■■□ 3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33,76■■■■□ 3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33,68■■■□□ 2,98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33,6■■■□□ 2,97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms