Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Patl2A2ARM1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Patl2A2ARM1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Patl2A2ARM1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Patl2A2ARM1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Patl2A2ARM1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Patl2A2ARM1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Patl2A2ARM1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Patl2A2ARM1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Patl2A2ARM1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Patl2A2ARM1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Patl2A2ARM1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Patl2A2ARM1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Patl2A2ARM1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Patl2A2ARM1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Patl2A2ARM1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Patl2A2ARM1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Patl2A2ARM1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Patl2A2ARM1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Patl2A2ARM1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Patl2A2ARM1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Patl2A2ARM1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Patl2A2ARM1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Patl2A2ARM1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Patl2A2ARM1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Patl2A2ARM1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Patl2A2ARM1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Patl2A2ARM1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Patl2A2ARM1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Patl2A2ARM1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Patl2A2ARM1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Patl2A2ARM1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Patl2A2ARM1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Patl2A2ARM1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Patl2A2ARM1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Patl2A2ARM1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Patl2A2ARM1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Patl2A2ARM1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Patl2A2ARM1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Patl2A2ARM1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Patl2A2ARM1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Patl2A2ARM1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Patl2A2ARM1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Patl2A2ARM1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Patl2A2ARM1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Patl2A2ARM1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Patl2A2ARM1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Patl2A2ARM1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Patl2A2ARM1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Patl2A2ARM1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Patl2A2ARM1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Patl2A2ARM1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Patl2A2ARM1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Patl2A2ARM1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Patl2A2ARM1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Patl2A2ARM1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Patl2A2ARM1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Patl2A2ARM1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Patl2A2ARM1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Patl2A2ARM1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Patl2A2ARM1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Patl2A2ARM1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Patl2A2ARM1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Patl2A2ARM1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Patl2A2ARM1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Patl2A2ARM1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 583.2 ms