Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r2A2AMT6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn1r2A2AMT6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r2A2AMT6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r2A2AMT6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r2A2AMT6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn1r2A2AMT6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vmn1r2A2AMT6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vmn1r2A2AMT6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r2A2AMT6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vmn1r2A2AMT6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r2A2AMT6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r2A2AMT6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r2A2AMT6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r2A2AMT6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r2A2AMT6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r2A2AMT6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r2A2AMT6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r2A2AMT6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r2A2AMT6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r2A2AMT6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r2A2AMT6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r2A2AMT6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r2A2AMT6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r2A2AMT6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r2A2AMT6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vmn1r2A2AMT6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r2A2AMT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r2A2AMT6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r2A2AMT6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r2A2AMT6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r2A2AMT6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r2A2AMT6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r2A2AMT6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r2A2AMT6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r2A2AMT6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r2A2AMT6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r2A2AMT6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms