Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2dnl2A2AFH2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2dnl2A2AFH2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2dnl2A2AFH2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2dnl2A2AFH2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2dnl2A2AFH2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2dnl2A2AFH2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2dnl2A2AFH2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2dnl2A2AFH2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2dnl2A2AFH2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2dnl2A2AFH2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2dnl2A2AFH2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2dnl2A2AFH2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2dnl2A2AFH2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube2dnl2A2AFH2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.3 ms