Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RlfA2A7F4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RlfA2A7F4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RlfA2A7F4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RlfA2A7F4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RlfA2A7F4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RlfA2A7F4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RlfA2A7F4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RlfA2A7F4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RlfA2A7F4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RlfA2A7F4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RlfA2A7F4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RlfA2A7F4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RlfA2A7F4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RlfA2A7F4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RlfA2A7F4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RlfA2A7F4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RlfA2A7F4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RlfA2A7F4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RlfA2A7F4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RlfA2A7F4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RlfA2A7F4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RlfA2A7F4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RlfA2A7F4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RlfA2A7F4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RlfA2A7F4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RlfA2A7F4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RlfA2A7F4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RlfA2A7F4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RlfA2A7F4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RlfA2A7F4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RlfA2A7F4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RlfA2A7F4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RlfA2A7F4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RlfA2A7F4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RlfA2A7F4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RlfA2A7F4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RlfA2A7F4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RlfA2A7F4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RlfA2A7F4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RlfA2A7F4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RlfA2A7F4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RlfA2A7F4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RlfA2A7F4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RlfA2A7F4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RlfA2A7F4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RlfA2A7F4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RlfA2A7F4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RlfA2A7F4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RlfA2A7F4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RlfA2A7F4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RlfA2A7F4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RlfA2A7F4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RlfA2A7F4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms