Protein–RNA interactions for Protein: A1L3P4

Slc9a6, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a6A1L3P4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a6A1L3P4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a6A1L3P4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a6A1L3P4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a6A1L3P4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a6A1L3P4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a6A1L3P4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a6A1L3P4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a6A1L3P4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a6A1L3P4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a6A1L3P4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a6A1L3P4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a6A1L3P4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a6A1L3P4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a6A1L3P4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a6A1L3P4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a6A1L3P4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a6A1L3P4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a6A1L3P4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a6A1L3P4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a6A1L3P4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a6A1L3P4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc9a6A1L3P4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc9a6A1L3P4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a6A1L3P4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a6A1L3P4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a6A1L3P4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a6A1L3P4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a6A1L3P4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9a6A1L3P4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a6A1L3P4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a6A1L3P4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a6A1L3P4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms